Nutzer können ihre Uptrends Accounts durch Einrichtung der Zwei-Faktor-Authentifizierung (2FA) bei den Operator Accounts schützen. Uptrends unterstützt die Zwei-Faktor-Authentifizierung mit zeitbasierten Einmal-Passwörtern (time-based one-time password, TOTP). Das heißt, Nutzer können ihre Anmeldeoptionen einfach mit Scannen eines QR-Codes mit jeder beliebigen Authentifizierungs-App konfigurieren.
Account-Administratoren können eine Nutzung von 2FA kontoweit oder einzeln für jeden Operator des Accounts festlegen. Nach der Einrichtung werden Operatoren aufgefordert, beim Anmelden zusätzlich zu ihren Anmeldedaten einen sechsstelligen Code, der von ihrer Authentifizierungs-App generiert wurde, in Uptrends einzugeben.